Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strip2Q8C9H6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strip2Q8C9H6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip2Q8C9H6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strip2Q8C9H6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Strip2Q8C9H6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip2Q8C9H6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip2Q8C9H6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strip2Q8C9H6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Strip2Q8C9H6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strip2Q8C9H6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strip2Q8C9H6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Strip2Q8C9H6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Strip2Q8C9H6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Strip2Q8C9H6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Strip2Q8C9H6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Strip2Q8C9H6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strip2Q8C9H6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strip2Q8C9H6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Strip2Q8C9H6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strip2Q8C9H6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Strip2Q8C9H6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Strip2Q8C9H6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Strip2Q8C9H6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Strip2Q8C9H6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Strip2Q8C9H6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Strip2Q8C9H6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Strip2Q8C9H6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Strip2Q8C9H6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Strip2Q8C9H6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strip2Q8C9H6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strip2Q8C9H6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strip2Q8C9H6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strip2Q8C9H6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Strip2Q8C9H6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Strip2Q8C9H6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Strip2Q8C9H6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Strip2Q8C9H6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Strip2Q8C9H6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Strip2Q8C9H6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Strip2Q8C9H6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Strip2Q8C9H6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Strip2Q8C9H6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Strip2Q8C9H6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Strip2Q8C9H6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strip2Q8C9H6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Strip2Q8C9H6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strip2Q8C9H6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strip2Q8C9H6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms