Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Pdcl3Q8BVF2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Pdcl3Q8BVF2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Pdcl3Q8BVF2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Pdcl3Q8BVF2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Pdcl3Q8BVF2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Pdcl3Q8BVF2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28,41■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Pdcl3Q8BVF2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Pdcl3Q8BVF2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Pdcl3Q8BVF2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Pdcl3Q8BVF2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Pdcl3Q8BVF2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Pdcl3Q8BVF2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Pdcl3Q8BVF2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Pdcl3Q8BVF2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Pdcl3Q8BVF2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Pdcl3Q8BVF2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Pdcl3Q8BVF2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Pdcl3Q8BVF2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Pdcl3Q8BVF2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Pdcl3Q8BVF2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Pdcl3Q8BVF2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pdcl3Q8BVF2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pdcl3Q8BVF2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pdcl3Q8BVF2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pdcl3Q8BVF2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pdcl3Q8BVF2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Pdcl3Q8BVF2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Pdcl3Q8BVF2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Pdcl3Q8BVF2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Pdcl3Q8BVF2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Pdcl3Q8BVF2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Pdcl3Q8BVF2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms