Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX3

Kctd3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd3Q8BFX3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kctd3Q8BFX3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kctd3Q8BFX3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kctd3Q8BFX3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kctd3Q8BFX3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kctd3Q8BFX3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kctd3Q8BFX3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kctd3Q8BFX3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kctd3Q8BFX3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kctd3Q8BFX3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kctd3Q8BFX3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kctd3Q8BFX3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kctd3Q8BFX3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kctd3Q8BFX3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kctd3Q8BFX3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kctd3Q8BFX3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kctd3Q8BFX3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kctd3Q8BFX3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kctd3Q8BFX3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kctd3Q8BFX3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kctd3Q8BFX3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kctd3Q8BFX3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kctd3Q8BFX3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kctd3Q8BFX3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kctd3Q8BFX3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kctd3Q8BFX3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kctd3Q8BFX3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kctd3Q8BFX3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kctd3Q8BFX3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kctd3Q8BFX3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Kctd3Q8BFX3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms