Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vgll4Q80V24 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll4Q80V24 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll4Q80V24 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll4Q80V24 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vgll4Q80V24 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vgll4Q80V24 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vgll4Q80V24 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vgll4Q80V24 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vgll4Q80V24 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vgll4Q80V24 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vgll4Q80V24 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vgll4Q80V24 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vgll4Q80V24 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vgll4Q80V24 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vgll4Q80V24 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vgll4Q80V24 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vgll4Q80V24 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vgll4Q80V24 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vgll4Q80V24 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vgll4Q80V24 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vgll4Q80V24 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vgll4Q80V24 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vgll4Q80V24 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vgll4Q80V24 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vgll4Q80V24 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vgll4Q80V24 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vgll4Q80V24 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vgll4Q80V24 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vgll4Q80V24 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vgll4Q80V24 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vgll4Q80V24 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vgll4Q80V24 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vgll4Q80V24 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vgll4Q80V24 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vgll4Q80V24 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vgll4Q80V24 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vgll4Q80V24 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms