Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kcnf1Q7TSH7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnf1Q7TSH7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnf1Q7TSH7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnf1Q7TSH7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnf1Q7TSH7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnf1Q7TSH7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnf1Q7TSH7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnf1Q7TSH7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnf1Q7TSH7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnf1Q7TSH7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnf1Q7TSH7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kcnf1Q7TSH7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kcnf1Q7TSH7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnf1Q7TSH7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcnf1Q7TSH7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcnf1Q7TSH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcnf1Q7TSH7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcnf1Q7TSH7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcnf1Q7TSH7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnf1Q7TSH7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnf1Q7TSH7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnf1Q7TSH7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnf1Q7TSH7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnf1Q7TSH7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnf1Q7TSH7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcnf1Q7TSH7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcnf1Q7TSH7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcnf1Q7TSH7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcnf1Q7TSH7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kcnf1Q7TSH7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kcnf1Q7TSH7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kcnf1Q7TSH7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kcnf1Q7TSH7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kcnf1Q7TSH7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kcnf1Q7TSH7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kcnf1Q7TSH7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kcnf1Q7TSH7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kcnf1Q7TSH7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms