Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf516Q7TSH3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf516Q7TSH3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf516Q7TSH3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf516Q7TSH3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf516Q7TSH3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf516Q7TSH3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf516Q7TSH3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf516Q7TSH3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf516Q7TSH3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf516Q7TSH3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf516Q7TSH3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf516Q7TSH3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf516Q7TSH3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf516Q7TSH3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf516Q7TSH3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf516Q7TSH3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf516Q7TSH3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf516Q7TSH3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf516Q7TSH3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf516Q7TSH3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf516Q7TSH3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf516Q7TSH3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf516Q7TSH3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf516Q7TSH3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf516Q7TSH3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf516Q7TSH3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf516Q7TSH3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf516Q7TSH3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf516Q7TSH3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf516Q7TSH3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf516Q7TSH3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf516Q7TSH3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf516Q7TSH3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf516Q7TSH3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf516Q7TSH3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf516Q7TSH3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf516Q7TSH3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf516Q7TSH3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf516Q7TSH3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf516Q7TSH3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf516Q7TSH3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf516Q7TSH3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf516Q7TSH3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf516Q7TSH3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf516Q7TSH3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf516Q7TSH3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf516Q7TSH3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf516Q7TSH3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf516Q7TSH3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf516Q7TSH3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf516Q7TSH3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf516Q7TSH3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf516Q7TSH3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf516Q7TSH3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms