Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcnpQ6P8I4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PcnpQ6P8I4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcnpQ6P8I4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PcnpQ6P8I4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcnpQ6P8I4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcnpQ6P8I4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcnpQ6P8I4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcnpQ6P8I4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcnpQ6P8I4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcnpQ6P8I4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PcnpQ6P8I4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcnpQ6P8I4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnpQ6P8I4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcnpQ6P8I4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcnpQ6P8I4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcnpQ6P8I4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PcnpQ6P8I4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcnpQ6P8I4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcnpQ6P8I4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnpQ6P8I4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnpQ6P8I4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PcnpQ6P8I4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnpQ6P8I4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PcnpQ6P8I4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnpQ6P8I4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcnpQ6P8I4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcnpQ6P8I4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcnpQ6P8I4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcnpQ6P8I4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PcnpQ6P8I4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PcnpQ6P8I4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PcnpQ6P8I4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PcnpQ6P8I4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PcnpQ6P8I4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PcnpQ6P8I4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PcnpQ6P8I4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PcnpQ6P8I4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PcnpQ6P8I4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PcnpQ6P8I4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PcnpQ6P8I4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PcnpQ6P8I4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PcnpQ6P8I4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms