Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt77Q6IFZ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt77Q6IFZ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt77Q6IFZ6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt77Q6IFZ6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt77Q6IFZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt77Q6IFZ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt77Q6IFZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt77Q6IFZ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt77Q6IFZ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt77Q6IFZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt77Q6IFZ6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt77Q6IFZ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt77Q6IFZ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt77Q6IFZ6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt77Q6IFZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt77Q6IFZ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt77Q6IFZ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt77Q6IFZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt77Q6IFZ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt77Q6IFZ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt77Q6IFZ6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt77Q6IFZ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt77Q6IFZ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt77Q6IFZ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt77Q6IFZ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt77Q6IFZ6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt77Q6IFZ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt77Q6IFZ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt77Q6IFZ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt77Q6IFZ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt77Q6IFZ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms