Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd33Q63994 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd33Q63994 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd33Q63994 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd33Q63994 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd33Q63994 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms