Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp1Q62442 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp1Q62442 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp1Q62442 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp1Q62442 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp1Q62442 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp1Q62442 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp1Q62442 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp1Q62442 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp1Q62442 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp1Q62442 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp1Q62442 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp1Q62442 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vamp1Q62442 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp1Q62442 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp1Q62442 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp1Q62442 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp1Q62442 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp1Q62442 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp1Q62442 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp1Q62442 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp1Q62442 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp1Q62442 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp1Q62442 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp1Q62442 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp1Q62442 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms