Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Scaf1Q5U4C3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Scaf1Q5U4C3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Scaf1Q5U4C3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Scaf1Q5U4C3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Scaf1Q5U4C3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scaf1Q5U4C3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Scaf1Q5U4C3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Scaf1Q5U4C3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Scaf1Q5U4C3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Scaf1Q5U4C3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Scaf1Q5U4C3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Scaf1Q5U4C3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Scaf1Q5U4C3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Scaf1Q5U4C3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Scaf1Q5U4C3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Scaf1Q5U4C3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Scaf1Q5U4C3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Scaf1Q5U4C3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Scaf1Q5U4C3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Scaf1Q5U4C3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Scaf1Q5U4C3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Scaf1Q5U4C3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Scaf1Q5U4C3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Scaf1Q5U4C3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Scaf1Q5U4C3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Scaf1Q5U4C3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Scaf1Q5U4C3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Scaf1Q5U4C3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Scaf1Q5U4C3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Scaf1Q5U4C3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Scaf1Q5U4C3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Scaf1Q5U4C3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Scaf1Q5U4C3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Scaf1Q5U4C3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Scaf1Q5U4C3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Scaf1Q5U4C3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Scaf1Q5U4C3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Scaf1Q5U4C3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Scaf1Q5U4C3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Scaf1Q5U4C3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Scaf1Q5U4C3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Scaf1Q5U4C3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Scaf1Q5U4C3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Scaf1Q5U4C3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Scaf1Q5U4C3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Scaf1Q5U4C3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Scaf1Q5U4C3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Scaf1Q5U4C3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Scaf1Q5U4C3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Scaf1Q5U4C3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Scaf1Q5U4C3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Scaf1Q5U4C3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Scaf1Q5U4C3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Scaf1Q5U4C3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Scaf1Q5U4C3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Scaf1Q5U4C3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Scaf1Q5U4C3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Scaf1Q5U4C3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Scaf1Q5U4C3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Scaf1Q5U4C3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Scaf1Q5U4C3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms