Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH62

Xkr9, XK-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr9Q5GH62 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xkr9Q5GH62 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xkr9Q5GH62 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Xkr9Q5GH62 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Xkr9Q5GH62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xkr9Q5GH62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xkr9Q5GH62 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xkr9Q5GH62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xkr9Q5GH62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xkr9Q5GH62 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Xkr9Q5GH62 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xkr9Q5GH62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xkr9Q5GH62 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xkr9Q5GH62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xkr9Q5GH62 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xkr9Q5GH62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xkr9Q5GH62 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xkr9Q5GH62 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xkr9Q5GH62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms