Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syce1lQ5D525 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syce1lQ5D525 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syce1lQ5D525 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syce1lQ5D525 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syce1lQ5D525 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syce1lQ5D525 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce1lQ5D525 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce1lQ5D525 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce1lQ5D525 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce1lQ5D525 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce1lQ5D525 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce1lQ5D525 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce1lQ5D525 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce1lQ5D525 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce1lQ5D525 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce1lQ5D525 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce1lQ5D525 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce1lQ5D525 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce1lQ5D525 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syce1lQ5D525 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce1lQ5D525 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce1lQ5D525 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1lQ5D525 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1lQ5D525 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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