Protein–RNA interactions for Protein: Q562E2

Kctd19, BTB/POZ domain-containing protein KCTD19, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd19Q562E2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Kctd19Q562E2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Kctd19Q562E2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Kctd19Q562E2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Kctd19Q562E2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Kctd19Q562E2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Kctd19Q562E2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Kctd19Q562E2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Kctd19Q562E2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Kctd19Q562E2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Kctd19Q562E2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Kctd19Q562E2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Kctd19Q562E2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Kctd19Q562E2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Kctd19Q562E2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Kctd19Q562E2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Kctd19Q562E2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Kctd19Q562E2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Kctd19Q562E2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Kctd19Q562E2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Kctd19Q562E2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Kctd19Q562E2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Kctd19Q562E2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Kctd19Q562E2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Kctd19Q562E2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Kctd19Q562E2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,95■■□□□ 1,75
Kctd19Q562E2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Kctd19Q562E2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Kctd19Q562E2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Kctd19Q562E2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Kctd19Q562E2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Kctd19Q562E2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Kctd19Q562E2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,4 ms