Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY34

Uncharacterized protein C12orf43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UY34 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UY34 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3UY34 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UY34 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UY34 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UY34 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UY34 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UY34 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3UY34 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UY34 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3UY34 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UY34 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UY34 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UY34 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UY34 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UY34 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UY34 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UY34 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UY34 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UY34 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UY34 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UY34 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q3UY34 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UY34 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UY34 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UY34 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UY34 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UY34 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UY34 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UY34 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UY34 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UY34 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3UY34 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3UY34 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3UY34 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q3UY34 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q3UY34 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q3UY34 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3UY34 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3UY34 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Q3UY34 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3UY34 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3UY34 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3UY34 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3UY34 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UY34 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UY34 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UY34 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q3UY34 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3UY34 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3UY34 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3UY34 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3UY34 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3UY34 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3UY34 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3UY34 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3UY34 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3UY34 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3UY34 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3UY34 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3UY34 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3UY34 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q3UY34 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q3UY34 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q3UY34 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q3UY34 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3UY34 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3UY34 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3UY34 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q3UY34 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3UY34 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3UY34 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q3UY34 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q3UY34 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q3UY34 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3UY34 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3UY34 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UY34 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UY34 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UY34 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q3UY34 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q3UY34 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q3UY34 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q3UY34 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3UY34 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3UY34 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3UY34 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Q3UY34 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q3UY34 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q3UY34 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Q3UY34 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Q3UY34 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3UY34 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3UY34 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3UY34 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3UY34 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3UY34 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3UY34 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3UY34 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q3UY34 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms