Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ41

Tmprss11a, Transmembrane protease serine 11A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11aQ3UQ41 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmprss11aQ3UQ41 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmprss11aQ3UQ41 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmprss11aQ3UQ41 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmprss11aQ3UQ41 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmprss11aQ3UQ41 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmprss11aQ3UQ41 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmprss11aQ3UQ41 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmprss11aQ3UQ41 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmprss11aQ3UQ41 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmprss11aQ3UQ41 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmprss11aQ3UQ41 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmprss11aQ3UQ41 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmprss11aQ3UQ41 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmprss11aQ3UQ41 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmprss11aQ3UQ41 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmprss11aQ3UQ41 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmprss11aQ3UQ41 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmprss11aQ3UQ41 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmprss11aQ3UQ41 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmprss11aQ3UQ41 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmprss11aQ3UQ41 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmprss11aQ3UQ41 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmprss11aQ3UQ41 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmprss11aQ3UQ41 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmprss11aQ3UQ41 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmprss11aQ3UQ41 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmprss11aQ3UQ41 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms