Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Plxnd1Q3UH93 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Plxnd1Q3UH93 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Plxnd1Q3UH93 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Plxnd1Q3UH93 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Plxnd1Q3UH93 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Plxnd1Q3UH93 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Plxnd1Q3UH93 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Plxnd1Q3UH93 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Plxnd1Q3UH93 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Plxnd1Q3UH93 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Plxnd1Q3UH93 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Plxnd1Q3UH93 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Plxnd1Q3UH93 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Plxnd1Q3UH93 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Plxnd1Q3UH93 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Plxnd1Q3UH93 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Plxnd1Q3UH93 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Plxnd1Q3UH93 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Plxnd1Q3UH93 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Plxnd1Q3UH93 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Plxnd1Q3UH93 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Plxnd1Q3UH93 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Plxnd1Q3UH93 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Plxnd1Q3UH93 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Plxnd1Q3UH93 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Plxnd1Q3UH93 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Plxnd1Q3UH93 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Plxnd1Q3UH93 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Plxnd1Q3UH93 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Plxnd1Q3UH93 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Plxnd1Q3UH93 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Plxnd1Q3UH93 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Plxnd1Q3UH93 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Plxnd1Q3UH93 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Plxnd1Q3UH93 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Plxnd1Q3UH93 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Plxnd1Q3UH93 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Plxnd1Q3UH93 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Plxnd1Q3UH93 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Plxnd1Q3UH93 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Plxnd1Q3UH93 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Plxnd1Q3UH93 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Plxnd1Q3UH93 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Plxnd1Q3UH93 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,3 ms