Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hectd3Q3U487 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hectd3Q3U487 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hectd3Q3U487 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hectd3Q3U487 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hectd3Q3U487 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hectd3Q3U487 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hectd3Q3U487 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hectd3Q3U487 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hectd3Q3U487 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hectd3Q3U487 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hectd3Q3U487 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hectd3Q3U487 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hectd3Q3U487 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hectd3Q3U487 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hectd3Q3U487 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hectd3Q3U487 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hectd3Q3U487 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hectd3Q3U487 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hectd3Q3U487 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hectd3Q3U487 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hectd3Q3U487 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hectd3Q3U487 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hectd3Q3U487 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hectd3Q3U487 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hectd3Q3U487 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hectd3Q3U487 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hectd3Q3U487 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hectd3Q3U487 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hectd3Q3U487 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hectd3Q3U487 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hectd3Q3U487 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hectd3Q3U487 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hectd3Q3U487 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hectd3Q3U487 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hectd3Q3U487 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms