Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRG0

Gm1604b, Gene model 1604B, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1604bQ3TRG0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1604bQ3TRG0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1604bQ3TRG0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm1604bQ3TRG0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm1604bQ3TRG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm1604bQ3TRG0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm1604bQ3TRG0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm1604bQ3TRG0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm1604bQ3TRG0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm1604bQ3TRG0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm1604bQ3TRG0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1604bQ3TRG0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1604bQ3TRG0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm1604bQ3TRG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm1604bQ3TRG0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm1604bQ3TRG0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm1604bQ3TRG0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm1604bQ3TRG0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm1604bQ3TRG0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm1604bQ3TRG0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm1604bQ3TRG0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm1604bQ3TRG0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm1604bQ3TRG0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.5 ms