Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccbe1Q3MI99 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccbe1Q3MI99 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccbe1Q3MI99 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccbe1Q3MI99 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccbe1Q3MI99 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccbe1Q3MI99 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccbe1Q3MI99 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccbe1Q3MI99 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccbe1Q3MI99 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccbe1Q3MI99 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccbe1Q3MI99 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccbe1Q3MI99 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccbe1Q3MI99 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccbe1Q3MI99 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccbe1Q3MI99 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccbe1Q3MI99 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccbe1Q3MI99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccbe1Q3MI99 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccbe1Q3MI99 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccbe1Q3MI99 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccbe1Q3MI99 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccbe1Q3MI99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccbe1Q3MI99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccbe1Q3MI99 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms