Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
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Shroom4Q1W617 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Shroom4Q1W617 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Shroom4Q1W617 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Shroom4Q1W617 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Shroom4Q1W617 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Shroom4Q1W617 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Shroom4Q1W617 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Shroom4Q1W617 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Shroom4Q1W617 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Shroom4Q1W617 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Shroom4Q1W617 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Shroom4Q1W617 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Shroom4Q1W617 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Shroom4Q1W617 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Shroom4Q1W617 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Shroom4Q1W617 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Shroom4Q1W617 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Shroom4Q1W617 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Shroom4Q1W617 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Shroom4Q1W617 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Shroom4Q1W617 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
Shroom4Q1W617 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Shroom4Q1W617 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Shroom4Q1W617 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
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Shroom4Q1W617 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Shroom4Q1W617 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Shroom4Q1W617 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Shroom4Q1W617 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
Shroom4Q1W617 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Shroom4Q1W617 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Shroom4Q1W617 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Shroom4Q1W617 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Shroom4Q1W617 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
Shroom4Q1W617 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Shroom4Q1W617 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
Shroom4Q1W617 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Shroom4Q1W617 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Shroom4Q1W617 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Shroom4Q1W617 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Shroom4Q1W617 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
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Shroom4Q1W617 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Shroom4Q1W617 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Shroom4Q1W617 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Shroom4Q1W617 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Shroom4Q1W617 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Shroom4Q1W617 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
Shroom4Q1W617 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
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Shroom4Q1W617 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Shroom4Q1W617 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Shroom4Q1W617 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Shroom4Q1W617 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
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Shroom4Q1W617 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Shroom4Q1W617 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Shroom4Q1W617 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Shroom4Q1W617 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Shroom4Q1W617 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Shroom4Q1W617 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Shroom4Q1W617 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
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Shroom4Q1W617 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Shroom4Q1W617 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Shroom4Q1W617 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
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Shroom4Q1W617 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Shroom4Q1W617 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Shroom4Q1W617 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Shroom4Q1W617 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
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Shroom4Q1W617 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Shroom4Q1W617 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Shroom4Q1W617 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Shroom4Q1W617 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Shroom4Q1W617 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Shroom4Q1W617 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Shroom4Q1W617 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Shroom4Q1W617 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Shroom4Q1W617 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
Shroom4Q1W617 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Shroom4Q1W617 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Shroom4Q1W617 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Shroom4Q1W617 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Shroom4Q1W617 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Shroom4Q1W617 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Shroom4Q1W617 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Shroom4Q1W617 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Shroom4Q1W617 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Shroom4Q1W617 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Shroom4Q1W617 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Shroom4Q1W617 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Shroom4Q1W617 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Shroom4Q1W617 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms