Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col9a1Q05722 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col9a1Q05722 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col9a1Q05722 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col9a1Q05722 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col9a1Q05722 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col9a1Q05722 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col9a1Q05722 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col9a1Q05722 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col9a1Q05722 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col9a1Q05722 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col9a1Q05722 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col9a1Q05722 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col9a1Q05722 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col9a1Q05722 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col9a1Q05722 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col9a1Q05722 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col9a1Q05722 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col9a1Q05722 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Col9a1Q05722 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col9a1Q05722 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col9a1Q05722 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col9a1Q05722 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col9a1Q05722 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col9a1Q05722 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col9a1Q05722 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col9a1Q05722 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col9a1Q05722 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col9a1Q05722 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Col9a1Q05722 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col9a1Q05722 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col9a1Q05722 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col9a1Q05722 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col9a1Q05722 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Col9a1Q05722 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col9a1Q05722 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col9a1Q05722 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col9a1Q05722 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col9a1Q05722 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col9a1Q05722 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Col9a1Q05722 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col9a1Q05722 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col9a1Q05722 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col9a1Q05722 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col9a1Q05722 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col9a1Q05722 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col9a1Q05722 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col9a1Q05722 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col9a1Q05722 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col9a1Q05722 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col9a1Q05722 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col9a1Q05722 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col9a1Q05722 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms