Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,57■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,56■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Kcnd1Q03719 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Kcnd1Q03719 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Kcnd1Q03719 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Kcnd1Q03719 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Kcnd1Q03719 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Kcnd1Q03719 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Kcnd1Q03719 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Kcnd1Q03719 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Kcnd1Q03719 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Kcnd1Q03719 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Kcnd1Q03719 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Kcnd1Q03719 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Kcnd1Q03719 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Kcnd1Q03719 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Kcnd1Q03719 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Kcnd1Q03719 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Kcnd1Q03719 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Kcnd1Q03719 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Kcnd1Q03719 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Kcnd1Q03719 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Kcnd1Q03719 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Kcnd1Q03719 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Kcnd1Q03719 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Kcnd1Q03719 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Kcnd1Q03719 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Kcnd1Q03719 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Kcnd1Q03719 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Kcnd1Q03719 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms