Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms