Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp2P97299 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfrp2P97299 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp2P97299 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp2P97299 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfrp2P97299 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfrp2P97299 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms