Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufd1P70362 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufd1P70362 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufd1P70362 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufd1P70362 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufd1P70362 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ufd1P70362 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufd1P70362 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufd1P70362 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufd1P70362 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufd1P70362 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufd1P70362 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ufd1P70362 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufd1P70362 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ufd1P70362 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ufd1P70362 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufd1P70362 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ufd1P70362 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufd1P70362 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ufd1P70362 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms