Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdo1P60334 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdo1P60334 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdo1P60334 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdo1P60334 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdo1P60334 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdo1P60334 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdo1P60334 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdo1P60334 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdo1P60334 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdo1P60334 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdo1P60334 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdo1P60334 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdo1P60334 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdo1P60334 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdo1P60334 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdo1P60334 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdo1P60334 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdo1P60334 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdo1P60334 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdo1P60334 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdo1P60334 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdo1P60334 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdo1P60334 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdo1P60334 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdo1P60334 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdo1P60334 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdo1P60334 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdo1P60334 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cdo1P60334 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdo1P60334 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdo1P60334 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdo1P60334 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdo1P60334 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdo1P60334 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdo1P60334 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms