Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P58686 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P58686 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P58686 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P58686 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P58686 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P58686 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P58686 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P58686 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P58686 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P58686 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P58686 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P58686 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P58686 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P58686 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P58686 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P58686 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P58686 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P58686 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P58686 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P58686 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P58686 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P58686 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
P58686 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P58686 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P58686 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P58686 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P58686 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P58686 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P58686 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P58686 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P58686 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P58686 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P58686 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P58686 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P58686 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P58686 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P58686 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P58686 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P58686 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
P58686 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P58686 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P58686 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P58686 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P58686 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P58686 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
P58686 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P58686 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P58686 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P58686 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P58686 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P58686 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P58686 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P58686 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P58686 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P58686 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P58686 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P58686 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P58686 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P58686 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P58686 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P58686 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P58686 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P58686 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P58686 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P58686 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P58686 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P58686 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P58686 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P58686 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P58686 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P58686 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P58686 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P58686 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P58686 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P58686 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
P58686 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P58686 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P58686 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P58686 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P58686 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P58686 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P58686 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P58686 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P58686 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P58686 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
P58686 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P58686 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P58686 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
P58686 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P58686 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
P58686 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P58686 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
P58686 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
P58686 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P58686 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P58686 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P58686 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P58686 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P58686 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms