Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PitpnbP53811 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PitpnbP53811 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PitpnbP53811 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PitpnbP53811 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PitpnbP53811 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PitpnbP53811 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PitpnbP53811 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PitpnbP53811 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PitpnbP53811 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PitpnbP53811 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PitpnbP53811 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PitpnbP53811 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PitpnbP53811 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PitpnbP53811 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PitpnbP53811 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PitpnbP53811 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms