Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RorcP51450 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RorcP51450 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RorcP51450 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RorcP51450 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RorcP51450 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RorcP51450 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RorcP51450 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RorcP51450 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RorcP51450 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RorcP51450 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RorcP51450 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RorcP51450 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RorcP51450 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RorcP51450 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RorcP51450 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RorcP51450 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RorcP51450 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RorcP51450 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RorcP51450 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RorcP51450 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RorcP51450 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RorcP51450 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RorcP51450 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RorcP51450 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RorcP51450 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RorcP51450 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RorcP51450 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RorcP51450 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RorcP51450 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RorcP51450 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RorcP51450 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RorcP51450 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RorcP51450 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RorcP51450 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RorcP51450 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RorcP51450 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RorcP51450 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RorcP51450 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RorcP51450 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RorcP51450 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RorcP51450 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RorcP51450 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RorcP51450 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RorcP51450 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RorcP51450 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RorcP51450 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RorcP51450 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RorcP51450 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RorcP51450 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RorcP51450 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RorcP51450 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RorcP51450 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RorcP51450 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RorcP51450 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RorcP51450 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RorcP51450 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RorcP51450 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RorcP51450 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RorcP51450 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RorcP51450 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RorcP51450 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RorcP51450 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RorcP51450 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RorcP51450 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RorcP51450 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RorcP51450 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RorcP51450 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RorcP51450 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RorcP51450 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RorcP51450 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RorcP51450 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RorcP51450 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RorcP51450 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RorcP51450 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RorcP51450 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RorcP51450 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RorcP51450 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RorcP51450 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RorcP51450 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RorcP51450 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RorcP51450 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RorcP51450 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RorcP51450 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RorcP51450 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RorcP51450 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RorcP51450 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RorcP51450 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RorcP51450 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RorcP51450 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RorcP51450 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RorcP51450 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RorcP51450 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RorcP51450 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RorcP51450 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RorcP51450 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RorcP51450 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RorcP51450 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RorcP51450 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RorcP51450 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms