Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,32■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18,29■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18,29■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,28■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,28■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,28■□□□□ 0,52
Defa9P50707 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,28■□□□□ 0,52
Defa9P50707 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Defa9P50707 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Defa9P50707 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,26■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18,25■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18,24■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18,24■□□□□ 0,51
Defa9P50707 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18,24■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18,22■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Defa9P50707 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,19■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Defa9P50707 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18,14■□□□□ 0,5
Defa9P50707 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18,12■□□□□ 0,49
Defa9P50707 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,12■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Defa9P50707 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,08■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,08■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18,07■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18,07■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Defa9P50707 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,05■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,03■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18,03■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Defa9P50707 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Defa9P50707 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Defa9P50707 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,6 ms