Protein–RNA interactions for Protein: P49717

Mcm4, DNA replication licensing factor MCM4, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm4P49717 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mcm4P49717 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mcm4P49717 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mcm4P49717 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mcm4P49717 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mcm4P49717 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Mcm4P49717 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mcm4P49717 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mcm4P49717 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Mcm4P49717 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mcm4P49717 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mcm4P49717 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mcm4P49717 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mcm4P49717 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mcm4P49717 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mcm4P49717 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mcm4P49717 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mcm4P49717 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mcm4P49717 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mcm4P49717 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mcm4P49717 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mcm4P49717 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mcm4P49717 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mcm4P49717 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mcm4P49717 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mcm4P49717 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mcm4P49717 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mcm4P49717 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mcm4P49717 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Mcm4P49717 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mcm4P49717 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mcm4P49717 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mcm4P49717 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mcm4P49717 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Mcm4P49717 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mcm4P49717 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms