Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PfkmP47857 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PfkmP47857 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PfkmP47857 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PfkmP47857 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PfkmP47857 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PfkmP47857 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PfkmP47857 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PfkmP47857 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PfkmP47857 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PfkmP47857 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PfkmP47857 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PfkmP47857 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PfkmP47857 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PfkmP47857 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PfkmP47857 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PfkmP47857 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PfkmP47857 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PfkmP47857 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PfkmP47857 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PfkmP47857 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PfkmP47857 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PfkmP47857 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PfkmP47857 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PfkmP47857 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PfkmP47857 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PfkmP47857 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PfkmP47857 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PfkmP47857 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PfkmP47857 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PfkmP47857 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PfkmP47857 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PfkmP47857 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PfkmP47857 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PfkmP47857 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PfkmP47857 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PfkmP47857 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PfkmP47857 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PfkmP47857 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PfkmP47857 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PfkmP47857 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PfkmP47857 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PfkmP47857 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PfkmP47857 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PfkmP47857 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PfkmP47857 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PfkmP47857 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PfkmP47857 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PfkmP47857 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PfkmP47857 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PfkmP47857 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PfkmP47857 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PfkmP47857 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PfkmP47857 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PfkmP47857 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PfkmP47857 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PfkmP47857 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PfkmP47857 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PfkmP47857 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PfkmP47857 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PfkmP47857 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PfkmP47857 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PfkmP47857 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PfkmP47857 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PfkmP47857 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PfkmP47857 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PfkmP47857 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.3 ms