Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pdha1P35486 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdha1P35486 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdha1P35486 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdha1P35486 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdha1P35486 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdha1P35486 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdha1P35486 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdha1P35486 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdha1P35486 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdha1P35486 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdha1P35486 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdha1P35486 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdha1P35486 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdha1P35486 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdha1P35486 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdha1P35486 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pdha1P35486 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdha1P35486 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdha1P35486 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdha1P35486 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdha1P35486 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdha1P35486 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdha1P35486 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdha1P35486 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms