Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VimP20152 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VimP20152 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VimP20152 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VimP20152 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VimP20152 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VimP20152 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VimP20152 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VimP20152 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VimP20152 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VimP20152 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VimP20152 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VimP20152 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VimP20152 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VimP20152 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VimP20152 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VimP20152 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VimP20152 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VimP20152 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VimP20152 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VimP20152 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VimP20152 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VimP20152 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VimP20152 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VimP20152 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VimP20152 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VimP20152 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VimP20152 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VimP20152 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VimP20152 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VimP20152 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VimP20152 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VimP20152 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VimP20152 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VimP20152 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VimP20152 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VimP20152 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VimP20152 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VimP20152 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VimP20152 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VimP20152 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VimP20152 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VimP20152 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VimP20152 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VimP20152 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VimP20152 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VimP20152 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VimP20152 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VimP20152 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VimP20152 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VimP20152 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VimP20152 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VimP20152 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VimP20152 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VimP20152 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VimP20152 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VimP20152 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VimP20152 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VimP20152 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VimP20152 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VimP20152 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VimP20152 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VimP20152 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VimP20152 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VimP20152 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VimP20152 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VimP20152 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VimP20152 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VimP20152 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VimP20152 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VimP20152 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VimP20152 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VimP20152 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VimP20152 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VimP20152 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VimP20152 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VimP20152 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VimP20152 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VimP20152 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VimP20152 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VimP20152 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VimP20152 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VimP20152 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VimP20152 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VimP20152 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VimP20152 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VimP20152 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VimP20152 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VimP20152 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VimP20152 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VimP20152 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VimP20152 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VimP20152 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VimP20152 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VimP20152 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VimP20152 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VimP20152 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VimP20152 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VimP20152 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VimP20152 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms