Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NefhP19246 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NefhP19246 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NefhP19246 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NefhP19246 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NefhP19246 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NefhP19246 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NefhP19246 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NefhP19246 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NefhP19246 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NefhP19246 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NefhP19246 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NefhP19246 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefhP19246 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NefhP19246 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NefhP19246 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NefhP19246 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NefhP19246 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NefhP19246 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NefhP19246 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NefhP19246 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NefhP19246 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NefhP19246 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NefhP19246 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NefhP19246 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefhP19246 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefhP19246 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefhP19246 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NefhP19246 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NefhP19246 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NefhP19246 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefhP19246 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NefhP19246 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NefhP19246 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NefhP19246 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NefhP19246 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefhP19246 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NefhP19246 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NefhP19246 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NefhP19246 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NefhP19246 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NefhP19246 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NefhP19246 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NefhP19246 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NefhP19246 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NefhP19246 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NefhP19246 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NefhP19246 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefhP19246 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefhP19246 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefhP19246 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefhP19246 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NefhP19246 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NefhP19246 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NefhP19246 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefhP19246 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefhP19246 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NefhP19246 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NefhP19246 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NefhP19246 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NefhP19246 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NefhP19246 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NefhP19246 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefhP19246 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefhP19246 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NefhP19246 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NefhP19246 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NefhP19246 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NefhP19246 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NefhP19246 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NefhP19246 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NefhP19246 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefhP19246 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NefhP19246 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NefhP19246 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NefhP19246 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NefhP19246 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NefhP19246 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NefhP19246 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NefhP19246 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NefhP19246 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NefhP19246 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NefhP19246 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NefhP19246 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NefhP19246 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NefhP19246 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NefhP19246 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NefhP19246 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NefhP19246 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NefhP19246 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefhP19246 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefhP19246 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NefhP19246 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NefhP19246 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NefhP19246 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NefhP19246 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefhP19246 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefhP19246 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefhP19246 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NefhP19246 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms