Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
P18532 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P18532 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P18532 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P18532 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P18532 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P18532 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P18532 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P18532 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P18532 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P18532 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P18532 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P18532 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P18532 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P18532 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P18532 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P18532 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
P18532 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
P18532 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P18532 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P18532 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P18532 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P18532 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P18532 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P18532 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P18532 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P18532 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P18532 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P18532 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P18532 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P18532 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P18532 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P18532 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P18532 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P18532 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P18532 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P18532 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P18532 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P18532 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P18532 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
P18532 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P18532 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
P18532 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P18532 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P18532 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P18532 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P18532 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P18532 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P18532 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P18532 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P18532 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P18532 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P18532 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P18532 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
P18532 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P18532 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P18532 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P18532 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P18532 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P18532 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P18532 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P18532 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P18532 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P18532 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P18532 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P18532 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P18532 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P18532 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18532 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18532 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P18532 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P18532 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P18532 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P18532 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P18532 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
P18532 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P18532 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P18532 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P18532 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P18532 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P18532 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P18532 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P18532 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P18532 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P18532 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P18532 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P18532 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P18532 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P18532 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P18532 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P18532 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P18532 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18532 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18532 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18532 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P18532 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P18532 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P18532 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P18532 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P18532 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms