Protein–RNA interactions for Protein: P16301

Lcat, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcatP16301 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LcatP16301 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LcatP16301 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LcatP16301 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LcatP16301 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LcatP16301 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LcatP16301 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LcatP16301 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LcatP16301 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LcatP16301 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LcatP16301 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LcatP16301 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LcatP16301 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LcatP16301 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LcatP16301 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LcatP16301 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LcatP16301 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LcatP16301 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LcatP16301 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LcatP16301 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LcatP16301 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LcatP16301 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LcatP16301 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LcatP16301 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LcatP16301 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LcatP16301 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LcatP16301 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LcatP16301 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LcatP16301 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LcatP16301 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LcatP16301 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LcatP16301 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LcatP16301 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LcatP16301 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LcatP16301 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LcatP16301 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LcatP16301 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LcatP16301 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LcatP16301 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LcatP16301 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LcatP16301 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LcatP16301 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LcatP16301 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LcatP16301 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LcatP16301 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LcatP16301 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LcatP16301 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LcatP16301 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LcatP16301 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LcatP16301 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LcatP16301 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LcatP16301 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LcatP16301 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LcatP16301 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LcatP16301 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LcatP16301 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LcatP16301 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LcatP16301 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LcatP16301 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LcatP16301 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LcatP16301 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LcatP16301 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LcatP16301 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LcatP16301 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LcatP16301 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LcatP16301 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LcatP16301 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LcatP16301 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LcatP16301 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LcatP16301 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LcatP16301 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LcatP16301 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LcatP16301 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LcatP16301 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LcatP16301 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LcatP16301 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LcatP16301 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LcatP16301 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LcatP16301 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LcatP16301 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LcatP16301 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LcatP16301 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LcatP16301 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LcatP16301 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LcatP16301 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LcatP16301 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LcatP16301 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LcatP16301 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LcatP16301 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LcatP16301 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LcatP16301 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LcatP16301 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LcatP16301 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LcatP16301 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LcatP16301 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LcatP16301 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LcatP16301 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LcatP16301 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LcatP16301 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LcatP16301 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms