Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgf4P11403 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgf4P11403 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgf4P11403 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgf4P11403 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf4P11403 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf4P11403 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgf4P11403 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgf4P11403 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgf4P11403 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgf4P11403 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgf4P11403 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf4P11403 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf4P11403 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf4P11403 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf4P11403 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf4P11403 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf4P11403 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf4P11403 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf4P11403 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf4P11403 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgf4P11403 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgf4P11403 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fgf4P11403 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgf4P11403 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fgf4P11403 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fgf4P11403 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fgf4P11403 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgf4P11403 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fgf4P11403 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms