Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnp1P10856 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnp1P10856 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp1P10856 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnp1P10856 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnp1P10856 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms