Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl3P10855 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl3P10855 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccl3P10855 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl3P10855 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl3P10855 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccl3P10855 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl3P10855 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl3P10855 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl3P10855 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl3P10855 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl3P10855 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccl3P10855 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl3P10855 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl3P10855 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccl3P10855 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccl3P10855 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms