Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01734 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01734 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01734 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01734 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
P01734 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
P01734 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
P01734 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
P01734 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
P01734 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
P01734 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
P01734 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
P01734 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
P01734 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
P01734 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P01734 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P01734 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
P01734 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P01734 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P01734 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P01734 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
P01734 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
P01734 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
P01734 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
P01734 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P01734 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P01734 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P01734 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
P01734 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
P01734 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
P01734 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P01734 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
P01734 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
P01734 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01734 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01734 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01734 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01734 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P01734 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P01734 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P01734 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
P01734 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P01734 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P01734 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P01734 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P01734 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P01734 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
P01734 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P01734 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
P01734 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
P01734 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P01734 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
P01734 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P01734 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P01734 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P01734 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P01734 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
P01734 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P01734 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P01734 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
P01734 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
P01734 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
P01734 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
P01734 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
P01734 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
P01734 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
P01734 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
P01734 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
P01734 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
P01734 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01734 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01734 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01734 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01734 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
P01734 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
P01734 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
P01734 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
P01734 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
P01734 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
P01734 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P01734 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P01734 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P01734 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
P01734 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01734 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01734 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01734 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01734 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
P01734 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
P01734 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P01734 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P01734 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P01734 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P01734 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms