Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Stx8O88983 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Stx8O88983 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Stx8O88983 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Stx8O88983 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Stx8O88983 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Stx8O88983 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Stx8O88983 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Stx8O88983 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Stx8O88983 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Stx8O88983 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Stx8O88983 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Stx8O88983 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stx8O88983 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Stx8O88983 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stx8O88983 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Stx8O88983 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Stx8O88983 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Stx8O88983 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Stx8O88983 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stx8O88983 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Stx8O88983 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Stx8O88983 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stx8O88983 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stx8O88983 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stx8O88983 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stx8O88983 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Stx8O88983 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stx8O88983 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stx8O88983 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stx8O88983 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stx8O88983 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Stx8O88983 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Stx8O88983 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stx8O88983 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stx8O88983 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Stx8O88983 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Stx8O88983 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Stx8O88983 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Stx8O88983 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stx8O88983 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stx8O88983 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stx8O88983 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stx8O88983 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stx8O88983 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Stx8O88983 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Stx8O88983 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stx8O88983 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stx8O88983 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stx8O88983 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stx8O88983 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stx8O88983 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stx8O88983 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stx8O88983 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Stx8O88983 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Stx8O88983 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Stx8O88983 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stx8O88983 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms