Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd7O88665 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd7O88665 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd7O88665 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd7O88665 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd7O88665 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd7O88665 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd7O88665 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd7O88665 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd7O88665 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd7O88665 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd7O88665 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd7O88665 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd7O88665 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd7O88665 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd7O88665 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd7O88665 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brd7O88665 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd7O88665 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd7O88665 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd7O88665 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brd7O88665 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd7O88665 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd7O88665 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd7O88665 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd7O88665 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms