Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChadO55226 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ChadO55226 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChadO55226 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChadO55226 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChadO55226 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChadO55226 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChadO55226 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ChadO55226 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChadO55226 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChadO55226 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChadO55226 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChadO55226 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ChadO55226 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChadO55226 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChadO55226 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ChadO55226 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ChadO55226 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChadO55226 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChadO55226 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ChadO55226 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ChadO55226 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ChadO55226 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ChadO55226 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChadO55226 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ChadO55226 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChadO55226 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChadO55226 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChadO55226 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChadO55226 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ChadO55226 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ChadO55226 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ChadO55226 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ChadO55226 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ChadO55226 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChadO55226 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChadO55226 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChadO55226 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ChadO55226 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChadO55226 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChadO55226 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChadO55226 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChadO55226 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChadO55226 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChadO55226 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChadO55226 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChadO55226 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChadO55226 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ChadO55226 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ChadO55226 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ChadO55226 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ChadO55226 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ChadO55226 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ChadO55226 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChadO55226 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ChadO55226 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChadO55226 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChadO55226 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChadO55226 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ChadO55226 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ChadO55226 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ChadO55226 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ChadO55226 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChadO55226 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChadO55226 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChadO55226 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChadO55226 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChadO55226 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ChadO55226 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChadO55226 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChadO55226 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChadO55226 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChadO55226 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChadO55226 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChadO55226 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChadO55226 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChadO55226 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChadO55226 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChadO55226 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChadO55226 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChadO55226 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ChadO55226 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChadO55226 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChadO55226 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChadO55226 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChadO55226 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChadO55226 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChadO55226 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChadO55226 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ChadO55226 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ChadO55226 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ChadO55226 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ChadO55226 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ChadO55226 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ChadO55226 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChadO55226 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChadO55226 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChadO55226 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChadO55226 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ChadO55226 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms