Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Stag2O35638 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Stag2O35638 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Stag2O35638 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Stag2O35638 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Stag2O35638 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Stag2O35638 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Stag2O35638 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Stag2O35638 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Stag2O35638 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Stag2O35638 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Stag2O35638 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Stag2O35638 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Stag2O35638 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Stag2O35638 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Stag2O35638 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Stag2O35638 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Stag2O35638 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Stag2O35638 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Stag2O35638 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Stag2O35638 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Stag2O35638 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Stag2O35638 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Stag2O35638 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Stag2O35638 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Stag2O35638 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Stag2O35638 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Stag2O35638 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Stag2O35638 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Stag2O35638 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stag2O35638 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stag2O35638 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Stag2O35638 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Stag2O35638 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Stag2O35638 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Stag2O35638 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Stag2O35638 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stag2O35638 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Stag2O35638 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stag2O35638 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stag2O35638 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stag2O35638 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Stag2O35638 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Stag2O35638 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Stag2O35638 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Stag2O35638 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Stag2O35638 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Stag2O35638 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Stag2O35638 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Stag2O35638 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Stag2O35638 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Stag2O35638 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Stag2O35638 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Stag2O35638 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Stag2O35638 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Stag2O35638 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Stag2O35638 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Stag2O35638 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Stag2O35638 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Stag2O35638 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Stag2O35638 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Stag2O35638 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Stag2O35638 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Stag2O35638 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Stag2O35638 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Stag2O35638 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms