Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scamp3O35609 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scamp3O35609 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scamp3O35609 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Scamp3O35609 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scamp3O35609 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scamp3O35609 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scamp3O35609 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Scamp3O35609 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Scamp3O35609 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Scamp3O35609 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scamp3O35609 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Scamp3O35609 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scamp3O35609 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scamp3O35609 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scamp3O35609 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scamp3O35609 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scamp3O35609 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scamp3O35609 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scamp3O35609 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scamp3O35609 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scamp3O35609 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scamp3O35609 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scamp3O35609 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scamp3O35609 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scamp3O35609 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scamp3O35609 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scamp3O35609 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scamp3O35609 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scamp3O35609 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scamp3O35609 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scamp3O35609 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms