Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PbsnO08976 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PbsnO08976 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PbsnO08976 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PbsnO08976 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PbsnO08976 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PbsnO08976 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PbsnO08976 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PbsnO08976 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PbsnO08976 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PbsnO08976 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PbsnO08976 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PbsnO08976 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PbsnO08976 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PbsnO08976 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PbsnO08976 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PbsnO08976 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PbsnO08976 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PbsnO08976 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms