Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nfil3O08750 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nfil3O08750 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nfil3O08750 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nfil3O08750 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nfil3O08750 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nfil3O08750 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Nfil3O08750 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nfil3O08750 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nfil3O08750 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nfil3O08750 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nfil3O08750 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Nfil3O08750 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nfil3O08750 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nfil3O08750 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nfil3O08750 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nfil3O08750 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nfil3O08750 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nfil3O08750 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nfil3O08750 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nfil3O08750 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nfil3O08750 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nfil3O08750 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nfil3O08750 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nfil3O08750 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nfil3O08750 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nfil3O08750 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nfil3O08750 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nfil3O08750 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nfil3O08750 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nfil3O08750 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nfil3O08750 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nfil3O08750 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nfil3O08750 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nfil3O08750 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nfil3O08750 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nfil3O08750 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nfil3O08750 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nfil3O08750 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nfil3O08750 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nfil3O08750 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nfil3O08750 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nfil3O08750 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nfil3O08750 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nfil3O08750 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nfil3O08750 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nfil3O08750 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nfil3O08750 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nfil3O08750 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nfil3O08750 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nfil3O08750 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nfil3O08750 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nfil3O08750 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nfil3O08750 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms