Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mesp2O08574 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mesp2O08574 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mesp2O08574 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mesp2O08574 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mesp2O08574 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mesp2O08574 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mesp2O08574 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mesp2O08574 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mesp2O08574 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mesp2O08574 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mesp2O08574 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mesp2O08574 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mesp2O08574 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mesp2O08574 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mesp2O08574 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mesp2O08574 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mesp2O08574 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mesp2O08574 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mesp2O08574 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mesp2O08574 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mesp2O08574 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mesp2O08574 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mesp2O08574 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Mesp2O08574 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mesp2O08574 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms