Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0A8

Krtap20-2, Keratin-associated protein 20-2, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap20-2E9Q0A8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap20-2E9Q0A8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap20-2E9Q0A8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap20-2E9Q0A8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Krtap20-2E9Q0A8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms